Несмотря на разногласия, большинство граждан Алабамы поддержало Конфедерацию в войне с Северным Союзом - которая последовала за отделением южных штатов от США. В 1861году началась Гражданская война (American Civil War), которая продлилась до 1865 года и завершилась победой Союза. На территории Алабамы самой важной битвой в истории Гражданской войны считается Бой в бухте Мобил (Battle of Mobile Bay). (1864г) Адмирал Союзных войск Дэвид Джи. Фаррагут (David G. Farragut) разгромил флот Конфедерации, который защищал бухту.
Однако Конфедераты признали себя побежденными только в апреле 1865 года, после того, как кавалерия Союзных войск - почти опустошившая Джорджию - пронеслась, сметая все на своем пути, и по Алабамским землям.
Это интересно: